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Laboratoire des structures et interactions des macromolécules (LSIM)

Responsable : Zeina HOBAIKA (Maître de conférences)


Membres : Farah AMMAR (Post-doc), Léa El KOURY (Thésard)



Thématique:
Caractérisation, structure et fonction des protéines (Conception de drogue)


Description

Le VIH-1 est l'agent causal du SIDA. L'intégration de l'ADN du VIH-1 dans l'ADN des cellules infectées est catalysée par l'intégrase (IN) rétrovirale. Cette étape essentielle du cycle viral comporte deux étapes: La première est la maturation en 3' de l'ADN viral dans le cytoplasme et la deuxième est le transfert de brin dans le noyau. Les dicétoacides et leurs dérivés, tel le raltégravir, récemment autorisé en thérapie antivirale, inhibent préférentiellement la réaction de transfert de brin. D'autre part, il a été reporté à plusieurs reprises que le sang de certains malades séropositifs contenait des anticorps anti-intégrase. Cependant, le rôle exact de ses anticorps n'est pas connu. Ont-ils un pouvoir vaccinant? Notre thématique comporte deux volets: d'une part, l'étude des interactions de l’IN de VIH-1 avec l’ADN viral et interférence des inhibiteurs à activité antivirale et d'autre part l'étude des interactions et du caractère inhibiteur d’anticorps monoclonaux anti-IN avec IN et les domaines d’IN.


Collaborations nationales régionales et internationales


A l’échelle internationale : CNRS (UMR 8601 Paris – France), Laboratoire de l’Unité de Chimie, Biochimie, Pharmacologie et Toxicologie (LCBPT, CNRS UMR 8601, Paris V – France) 



Rayonnement

Publications (ne sont considérées que les publications datant de 2007. Les communications en général dans des congrès, colloques ou autres manifestations ne sont pas considérées dans cette brochure)

  • “Cytokine expression profile of sensitized T human lymphocytes following in vitro stimulation with amoxicillin” (2008). 
    Khalil G., El-Sabban M, Al-Ghadban S, Azzi S, Shamra S, Khalifé S and Maroun RG.Eur. Cytokine Netw. vol. 19 n° 3, 1-11.
  • “An Unusual Helix Turn Helix Motif in the Catalytic Core of HIV-1 Integrase Binds Viral DNA and LEDGF” (2008). 
    Merad H, Porumb H, Zargarian L, Rene´ B, Hobaika Z, Maroun RG, Mauffret O and Fermandjian S. Plos one. Vol. 4, issue 1, e4081.
  • “Specificity of LTR DNA Recognition by a Peptide Mimicking the HIV-1 Integrasea4 Helix” (2009). 
    Hobaika Z, Zargarian L, Boulard Y, Maroun RG, Mauffret O and Fermandjian S.Nucleic Acids Research. 37(22), 7691-7700.
  • “HIV-1 integrase and virus and cell DNAs: complex formation and perturbation by inhibitors of integration” (2009). 
    Hobaika Z, Zargarian L, Maroun RG, Mauffret O, Burke Jr. TR and Fermandjian S.Neurochem. Res. Nov, 1573–6903.
  • “The HIV-1 Integrase a4-Helix Involved in LTR-DNA Recognition Is also a Highly Antigenic Peptide Element” (2010).
    Azzi S, Parissi V, Maroun RG, Eid P, Mauffret O et Serge Fermandjian. PLoS ONE. 5(12): e16001.
  • “Monoclonal antibodies that recognize important functional elements of the HIV-1 integrase enzyme” (2012). 
    Maroun RG, Ammar F, Hobaika Z, Zargarian L, Fermandjian S. Retrovirology. 9 (Suppl 1): P6.
  • “Unprocessed viral DNA could be the primary target of the HIV-1 integrase inhibitor” (2012).
    Ammar F, Abdel-Azeim S, Zargarian L, Hobaika Z, Maroun RG, Fermandjian S. Raltegravir. PLoS ONE 7(7): e40223.
  • “Could an Anisotropic Molecular Mechanics/Dynamics Potential Account for Sigma Hole Effects in the Complexes of Halogenated Compounds?” (2013). 
    lHage K, Piquemal JP, Hobaika Z, Maroun RG and Gresh N. Journal of Computational Chemistry-12-0672.R1

Thèses 

2 thèses de doctorat en cours


Espaces occupés


Laboratoires de Biologie (FS/USJ), Centre d’Analyses et de Recherche (CAR/FS/USJ) 


Sources de financement

Conseil de la recherche de l’Université Saint-Joseph de Beyrouth. (CR), Centre National de la Recherche Scientifique-Libanais (CNRS-L), Programme Cèdre




 

Recherche
Unité de Recherche EGFEM
Unité de Recherche TVA
Publications
Thèses en Cours
Archive de thèses
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